الأسباب المتعلقة بالرحم :

1 - الأورام الليفية
2 - الالتهابات
3 - وجود بطانة مهاجرة في عضلة الرحم
4 - عيوب الخلقية في تكوين الرحم كوجود حاجز
5 - الأسباب المتعلقة بكمية الدم التي تصل إلى الرحم
6 - وجود خلايا طاردة
7 - وجود أجسام مضادة

الأسباب المتعلقة بالجنين :

١- إن جوهر نجاح الحقن المجهري وأطفال الأنابيب مقارنة بالوسائل الأخرى للعلاج هو الوصول إلى الجنين
٢- إن جوهر وأساس تحقيق نسب عالية للحمل في الحقن المجهري هو إمكانية اختيار أفضل الأجنة التي تصل إلى تحقيق الهدف وهو الوصول إلى طفل سليم ومعاف
٣- إن اختيار أفضل الأجنة مر علميا بمراحل مختلفة :
أ - الاعتماد على شكل الجنين وصنفنا الأجنة درجات لأننا وجدنا تزايد نسب الحمل كلما ارتفعت درجة الجنين
ب - نقل الجنين في اليوم الخامس بدل الثاني أو الثالث





ج ـ الانتقال إلى مرحلة اختيار الجنين بناء على جودته الحقيقية والمتمثلة في عدد الكروموسومات الموجودة بالجنين إن أهم سبب وأكثر الأسباب حدوثا لعدم نجاح الحقن المجهري هو نقل أجنة لا تحتوي على عدد سليم من الكروموسومات والذي لا يمكن توقعه أو التنبؤ به إلا عن طريق أخذ عينة من الجنين وتحليل عدد الكروموسومات بها